Typo3 schreibt standardmäßig CSS-Daten und JavaScript in den HEAD-Bereich der HTML-Dateien. Um diese in externe Dateien auszulagern und eine Verknüpfung zu erstellen, müssen diese beiden Zeilen Code in das SETUP-Feld eingetragen werden:

config.inlineStyle2TempFile = 1
config.removeDefaultJS = external 

Zeile 1 ist für das Auslagern der CSS-Daten verantwortlich.
Zeile 2 ist für das Auslagern von JavaScript verantwortlich.